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BIE 5781 Modelagem Estatística para Ecologia e Recursos Naturais LEITURAS |
Estes são os textos que discutiremos durante a disciplina.
As leituras principais são artigos e partes de livros escolhidos por apresentarem de maneira mais simples e operacional os conceitos básicos, de leitura obrigatória.
As leituras complementares são indicações para os que quiserem se avançar um pouco mais, de leitura opcional.
Após a disciplina, você poderá aprofundar-se e compreender a teoria subjacente se estudar a literatura essencial, indicada na bibliografia básica.
Nota
A Resolução 5213 da Reitoria da USP permite que professores disponibilizem artigos e partes de livros adotados para uso estrito nas atividades de sua disciplina, apenas pelos alunos regularmente inscritos nela.
Modelos em Ecologia e Recursos Florestais
Principais
- Hilborn, R. & Mangel, M. (1997). The Ecological Detective – Confronting Models with Data. Princeton, Princeton University Press.
- Johnson, J. B. & Omland, K. S. (2004). Model selection in ecology and evolution. Trends in Ecology and Evolution 19:101-108 pdf
Complementar
- Hilborn, R. & Mangel, M. (1997). The Ecological Detective – Confronting Models with Data. Princeton, Princeton University Press.
1. Distribuições Discretas
Principal
- Probability and stochastic distributions for ecological modeling. Capítulo 4, itens 4.4, e 4.5.1 de:Bolker, B.M. 2008 Ecological Models and Data in R Princeton: Princeton University Press.
Complementares
- Probability and stochastic distributions for ecological modeling. Capítulo 4, itens 4.1, 4.2, 4.3 de:Bolker, B.M. 2008 Ecological Models and Data in R Princeton: Princeton University Press.
- Random variables and probability distributions. Cap.2 de Gotelli, N.J. & Ellison, A.M. 2004. A primer of ecological statistics. Sinauer.
- Otto, S. P. & Day, T. (2007). A biologist's guide to mathematical modelling in ecology and evolution. Princenton, Princenton University Press.
2. Distribuições Contínuas
Principal
- Probability and stochastic distributions for ecological modeling. Capítulo 4, item 4.5.2 de:Bolker, B.M. 2008 Ecological Models and Data in R Princeton: Princeton University Press.
Complementar
- Randon variables and probability distributions. Cap.2 de Gotelli, N.J. & Ellison, A.M. 2004. A primer of ecological statistics. Sinauer.
- Otto, S. P. & Day, T. (2007). A biologist's guide to mathematical modelling in ecology and evolution. Princenton, Princenton University Press.
3. Função de Verossimilhança
Principal
Complementar
- Batista, J.L.F. 2014 Biometria Florestal segundo o Axioma da Verossimilhança. ESALQ-USP, Tese de Livre Docência, 391p.
- Likelihood and all that. capítulo 6 de:Bolker, B.M. 2008 Ecological Models and Data in R Princeton: Princeton University Press.
- The Concept of Likelihood , cap.2 de: Edwards, A.W.F., 1992 Likelihood. Baltimore: John Hopkins University Press.
- Hobbs, N.T. & Hilborn, R. (2006). Alternatives to statistical hypothesis testing in ecology: A guide to self-teaching. Ecological Applications: 16(1): 5-19.
4. Modelos c/ Parâmetros Constantes
Principal
- Likelihood and All That, seções 6.1 a 6.2.1.2 do Capítulo 6 de: Bolker, B.M. 2008 Ecological Models and Data in R Princeton: Princeton University Press.
Complementar
- Anderson, D. R. (2008). Model based inference in the life sciences: a primer on evidence. New York, Springer.
5. Modelos Binomial e Poisson
Principais
-
- Cap.6 - Likelihood and all that, seção 6.3.1
- Cap.9 - Standard Statistics Revisited, seção 9.4
Complementares
- Crawley, M.J. 2007. The R Book. New York, Wiley.
6. Modelos Gaussianos
Principal
- Standard Statistics Revisited, seções 9.1 a 9.3, capítulo 9 de:Bolker, B.M. 2008 Ecological Models and Data in R Princeton: Princeton University Press.
Complementar
- Likelihood and least squares theory. Seção 1.2.2 do Cap.1 de Burnham, K. P., & Anderson, D. R. (2002). Model Selection and Multimodel Inference: A Practical-Theoretic Approach, 2nd ed. New York, Springer-Verlag.
7. Seleção de Modelos
Principal
- Information and likelihood theory. Cap.2 de Burnham, K. P., & Anderson, D. R. (2002). Model Selection and Multimodel Inference: A Practical-Theoretic Approach, 2nd ed. New York, Springer-Verlag.
Complementares
8. Inferência por Verossimilhança
Principais
- Royall, R. M. (2007) The likelihood paradigm for statistical evidence. In: The nature of scientific evidence (eds. ML Taper and SR Lele), University of Chicago Press, pp 119–152. pdf
- Lewin-Koh N., Taper, M. L. & Lele, S. R. (2004). A brief tour of statistical concepts. In: The nature of scientific evidence (eds. ML Taper and SR Lele), University of Chicago Press, pp 3 -16. pdf.
Complementares
- Sober, E. 2008. Evidence and Evolution: the logic behind the science. Cambridge, Cambridge University Press. cap.1 - Evidence.
- "Likelihood": Uma palestra de A. W. F. Edwards.
- Berger, J.O. & Wolpert, R.L. 1984. The likelihood principle.Lecture Notes–IMS Monograph Series, Volume 6.
9. Fundamentos de Otimização
Principal
- Optimization and All That. Capítulo 7 de:Bolker, B.M. 2008 Ecological Models and Data in R Princeton: Princeton University Press.
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