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historico:2022:avaliacao

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historico:2022:avaliacao [2022/11/11 13:17] – [Como e quando entregar] paulohistorico:2022:avaliacao [2022/11/24 14:12] (atual) – edição externa 127.0.0.1
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 +~~NOTOC~~
 +|  {{ :likelihood_13.png?nolink&170 |Superfície de Verossimilhança}}  |  <html><font size=6 face="Times New Roman">BIE 5781 Modelagem Estatística para Ecologia e Recursos Naturais<br>Trabalho Final 2022</font></html>  |
  
 +
 +<html>
 +<font size=10>
 +   Trabalho Final
 +</font>
 +</html>
 +
 +
 +====== O que devo fazer? ======
 +
 +Aplicar os métodos e a lógica de inferência baseada em modelos apresentadas na disciplina para
 +responder a uma questão ou testar uma hipótese com um conjunto de dados.
 +
 +
 +====== Trabalho em grupo ou individual? ======
 +
 +Em duplas.
 +
 +====== Que dados usar? ======
 +
 +Fica a critério do grupo. Dados empíricos próprios ou publicados, ou mesmo dados simulados. O grupo também pode solicitar conjuntos de dados aos professores.
 +
 +
 +====== Conteúdo do relatório ======
 +
 +  - **Contextualização**: um a dois parágrafos com os elementos estritamente necessários para que se entenda a pergunta ou hipótese.
 +  - **Objetivos**: enunciado claro e preciso da pergunta a responder ou hipótese a testar.
 +  - **Dados usados** : descrição do conjunto de dados e dos aspectos essenciais dos métodos pelos quais foram obtidos.
 +  - **Métodos de análise**: Descrição dos métodos de análise.
 +  - **Resultados**: resultados das análises, incluindo tabelas e figuras.
 +  - **Discussão e conclusões**: o que se pode concluir do resultados, acompanhado das justificativas e ressalvas necessárias.
 +  - Referências bibliográficas
 +
 +
 +====== Como preparar? ======
 +
 +O trabalho deve ser feito no padrão de [[https://www.r-bloggers.com/what-is-reproducible-research/|pesquisa reproduzível]]. Isso significa que o grupo deve entregar o relatório e tudo que é necessário para reproduzí-lo (normalmente arquivo de dados e códigos das análises).
 +
 +Recomendamos o uso das ferramentas de programação literária (//literate programming//) do R, que permitem combinar códigos de R e textos para gerar um relatório dinâmico. Para os que não estão familiarizados a melhor opção é usar o Rmarkdown com o Rstudio. 
 +
 +====== O que entregar ======
 +===== Se usar ferramentas de literate programming (recomendado)=====
 +Um pacote de arquivos em formato ''zip'', ''tar'' ou ''tar.gz'' com:
 +
 +  * Documento-fonte do relatório ((que conterá o texto + códigos R embebidos, veja instruções da ferramenta de literate programing que escolher));
 +  * Arquivo pdf do relatório compilado;
 +  * Arquivo de dados em formato ''csv''.
 +
 +===== Se não usar literate programming=====
 +
 +Um pacote de arquivos em formato ''zip'', ''tar'' ou ''tar.gz'' com:
 +
 +  * Arquivo do relatório no processador de textos;
 +  * Arquivo pdf do relatório;
 +  * Arquivo com códigos em R das análises, **com comentários informativos sobre cada etapa realizada**;
 +  * Arquivo de dados em formato ''csv''.
 +
 +====== Como e quando entregar ======
 +
 + Envie o pacote de arquivos para [[prado@ib.usp.br]] e [[batista.jlf@usp.br]] até **28 de novembro de 2022**.
 +
 +====== Links úteis ======
 +
 +  * [[http://rmarkdown.rstudio.com/|Página sobre Rmarkdown]], no site do [[https://www.rstudio.com/|RStudio]]
 +  * Resumo dos recursos para pesquisa reproduzível do site oficial do R: https://cran.r-project.org/web/views/ReproducibleResearch.html
 +  * [[https://www.statistik.lmu.de/~leisch/Sweave/|Sweave]] e [[http://yihui.name/knitr/|Knitr]], as opções para //literate programming// mais usadas por usuários de LaTex.
 +  * [[https://en.wikipedia.org/wiki/Literate_programming|Verbete sobre literate programming]] na Wikipedia, para quem quiser se aprofundar nos conceitos.
 +  * [[https://liibre.github.io/curso/|Projetos de análise de dados usando R]], disciplina com excelentes aulas e tutoriais sobre reprodutibilidade e uso do Rmarkdown. Pelo [[https://github.com/liibre| Lab Independente de Informática da Biodiversidade e Reprodutibilidade em Ecologia]]
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